Please use this identifier to cite or link to this item: https://dspace.dsau.dp.ua/handle/123456789/4666
Title: Genome analysis of the monoclonal marbled crayfish reveals genetic separation over a short evolutionary timescale
Other Titles: Аналіз геному моноклональних мармурових раків виявляє генетичне розділення протягом короткого еволюційного періоду
Authors: Maiakovska, Olena
Маяковська, Олена
Andriantsoa, Ranja
Андріанцоа, Ранджа
Tönges, Sina
Тонгес, Сіна
Legrand, Carine
Легран, Карін
Gutekunst, Julian
Гутекунст, Джуліан
Hanna, Katharina
Ганна, Катаріна
Pârvulescu, Lucian
Парвулеску, Лючан
Novitsky, R. A.
Novitsky, R. O.
Novitskiy, R. A.
Novitskiy, R. O.
Novickii, R. A.
Novitskij, R. A.
Novitskij, R. O.
Nowicki, R. A.
Novickij, R. A.
Novitskyy, R. O.
Novitskyi, R. O.
Novitsky, Roman O.
Novitskiy, Roman
Novitskiy, R.
Novits’kyy, R. O.
Novyts’kyy, R. O.
Novitskyi, Roman O.
Novitsky, Roman
Новіцький, Роман Олександрович
Weiperth, András
Вайперт, Андраш
Sciberras, Arnold
Шиберрас, Арнольд
Deidun, Alan
Дейдун, Алан
Ercoli, Fabio
Ерколі, Фабіо
Kouba, Antonin
Куба, Антонін
Lyko, Frank
Ліко, Франк
Keywords: populiatsiia
популяція
marmurovi raky
мармурові раки
henom
геном
Issue Date: 2021
Publisher: Springer Science and Business Media
Citation: Maiakovska, O., Andriantsoa, R., Tönges, S., Legrand, C., Gutekunst, J., Hanna, K., … Lyko, F. (2021). Genome analysis of the monoclonal marbled crayfish reveals genetic separation over a short evolutionary timescale. Communications Biology, 4(1). doi:10.1038/s42003-020-01588-8. URI : http://dspace.dsau.dp.ua/jspui/handle/123456789/4666.
Abstract: The marbled crayfish (Procambarus virginalis) represents a very recently evolved parthenogenetic freshwater crayfish species that has invaded diverse habitats in Europe and in Madagascar. However, population genetic analyses have been hindered by the homogeneous genetic structure of the population and the lack of suitable tools for data analysis. We have used whole-genome sequencing to characterize reference specimens from various known wild populations. In parallel, we established a whole-genome sequencing data analysis pipeline for the population genetic analysis of nearly monoclonal genomes. Our results provide evidence for systematic genetic differences between geographically separated populations and illustrate the emerging differentiation of the marbled crayfish genome. We also used mark-recapture population size estimation in combination with genetic data to model the growth pattern of marbled crayfish populations. Our findings uncover evolutionary dynamics in the marbled crayfish genome over a very short evolutionary timescale and identify the rapid growth of marbled crayfish populations as an important factor for ecological monitoring. Мармурові раки ( Procambarus virginalis) представляє зовсім недавно еволюціонований партеногенетичний вид прісноводних раків, який вторгся в різноманітні середовища існування в Європі та на Мадагаскарі. Однак генетичному аналізу популяції заважає однорідна генетична структура популяції та відсутність відповідних інструментів для аналізу даних. Ми використовували секвенування цілого геному для характеристики еталонних зразків різних відомих диких популяцій. Паралельно ми встановили конвеєр аналізу даних секвенування цілого генома для популяційного генетичного аналізу майже моноклональних геномів. Наші результати дають докази систематичних генетичних відмінностей між географічно відокремленими популяціями та ілюструють диференціацію генома мармурових раків. Ми також використовували оцінку розміру популяції для відловлювання міток у поєднанні з генетичними даними для моделювання моделі зростання популяцій мармурових раків. Отримані нами результати виявляють еволюційну динаміку в геномі мармурових раків за дуже короткий еволюційний часовий проміжок та визначають швидке зростання популяцій мармурових раків як важливий фактор екологічного моніторингу.
Description: Новіцький Роман Олександрович https://orcid.org/0000-0001-9373-5759
URI: https://www.nature.com/articles/s42003-020-01588-8
http://dspace.dsau.dp.ua/jspui/handle/123456789/4666
Appears in Collections:Наукові статті

Files in This Item:
File Description SizeFormat 
s42003-020-01588-8.pdf1,15 MBAdobe PDFView/Open


Items in DSpace are protected by copyright, with all rights reserved, unless otherwise indicated.